В сложный период 1990-х годов Таджикистан пережил падение поголовья овец и коз. С 2002 года улучшается состояние национальной экономики и растет поголовье. Начиная с 1997 года, в течение 12 лет поголовье коз увеличилась на 75%.

Как и в других бывших советских республиках Центральной Азии, программа разведения коз была создана для производства ангоры. Одна новая порода, которая называется Советский Мохер (сейчас Таджикский Мохер), была широко внедрена в Согдийской области на северо-западе. Другая порода, которая называется Памирская Пушистая была выведена из Ангоры, породы Дон и местной породы коз была введен в Горно-Бадахшане (восточная часть Таджикистана). Мохер, собираемый с этих пород коз пользовался большим спросом в СССР. До сих пор еще существует спрос на это волокно. Однако, как и в Казахстане, и в Кыргызстане, в постсоветский период в Таджикистане многие советские породы были скрещены с местными породами коз и в результате качества волокна невысокое и спрос на него не очень высокий.

Начиная с конца 1990-х годов, торговцы из соседних стран, таких как Китай, Узбекистан и Киргизия начали торговать с жителями горных районов Таджикистана. Торговля заключалась в обмене товаров повседневного спроса, каких как мыло, на козьи шкуры, с которых в последствии торговцы вычесывали пух (кашемир). Так же как и в Кыргызстане, и в Казахстане, в стране не было правительственных или международных программ по содействию жителям Таджикистана в развитии рынка кашемира.

В 2003 году были взяты образцы пуха Таджикской породы в шести горных районах Раштской долины и Горно-Бадахшана и испытаны в Великобритании. Образцы из районов Джиргитол, Тоджикабод, Рашт и Вандж оказались очень хорошего качества, в среднем их толщина была от 14 до 15,3 мкм. Однако большинство образцов от двух других районов (Мургаба и Шугнон провинции Горно-Бадахшанской области), не отвечают международным стандартам кашемира — их диаметр больше установленной международными стандартами толщины кашемира. Это последствия скрещивания с советскими мохеровыми породами.

В другом горном регионе Зеравшанской долины в трех районах в 2007 году так же были взяты образцы пуха коз. В Айнинском районе срений диаметр волокон был 14,3 мкм (65 образцов) со стандартным отклонением в размере 2,9. Волокна взятые Пенджикентском районе (68 образцов) средний диаметр был 15,1 мкм со стандартным отклонением 3.0. В районе Кухистони Мастчох были, как минимум, хорошие хорошие результаты, со средним диаметром волокон 16,9 мкм (54 образцов) со стандартным отклонением 3.3, и более длинные чем обычно. В советский период козы породы Советский мохер были интродуцированны в район Кухистони Мастчох. Что касается цвета, 14% образцов были белые, а еще 25% светлые. Белый и светлые тона предпочтительны в кашемировой промышленности, поскольку они могут быть окрашены в различные цвета без предварительного отбеливания.